همهی آنهایی که با مجنتو نسخهی ۱ کار کردهاند میدانند که باید با پوشههای زیاد و تودرتو سر و کله بزنند. به طور مثال برای نصب کردن افزونهی وبلاگ ساخت شرکت aheadWorks باید فایلهای افزونه در این پوشهها قرار داده شود:
- app/code/community
- app/code/local
- app/design/adminhtml
- app/design/frontend
- app/locale/en_US
- app/locale/fa_IR (اگر افزونه نیازمند فارسیسازی باشد)
- app/etc/modules
- js
- lib
- skin/adminhtml
- skin/frontend
معمولا فروشگاههای ساخته شده با مجنتو به بیش از یک افزونه نیازمندند. درگاههای بانکی (ملت، سامان، پاسارگاد و غیره)، افزونههای ارسال پستی (پست پیشتاز، تیپاکس و غیره)، وبلاگ، ارسال پیامک، شهرها و استانهای ایران، افزونههای آنالیز (piwik و google analytics)، ارتباط با مشتری (zopim و olark) و بسیاری دیگر. این افزونهها کمک میکنند تا مشتریان تجربهی خرید راحتی داشته باشند و مدیران بتوانند خدمات بهتری ارائه دهند.